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FICHE EXAMEN
RECHERCHE DE TRANSCRITS PAR RT-PCR
Révisé le 01/12/2022 13:40:00
EXAMEN
ExamenRECHERCHE DE TRANSCRITS PAR RT-PCR
Synonymesrecherche et/ou quantification de transcrits, transcrits de fusion BCR-ABL,AML1-ETO,CBFB-MYH11,PML-RARA,MLL-AF9,MLL-AF4,E2A-PBX1, SIL-TAL, TEL-AML1 (ETV6-RUNX1),FIP1L1-PDGFRA, TEL-PDGFRB,EWS-FLI1,TH, DCX, PHOXB2
Service exécutantCYTOGÉNÉTIQUE
SiteCHU ESTAING
Laboratoire exécutant
CHU CLERMONT-FERRAND
Principales indicationsPrincipaux transcrits de fusion des LAM : AML1-ETO, CBFB-MYH11, PML-RARA, MLL-AF9, MLL-AF6, MLL-ENL, MLL-ELL
Principaux transcrits de fusion des LAL : MLL-AF4, E2A-PBX1, SIL-TAL, TEL-AML1 (ETV6-RUNX1), BCR-ABL
Principaux transcrits de fusion des SMP : BCR-ABL, FIP1L1-PDGFRA, TEL-PDGFRB
Autres transcrits de fusion rares : contacter les biologistes.
Transcrit du sarcome d’Ewing/PNET : EWS-FLI1
En cas de neuroblastome : quantification des transcrits de la Tyrosine Hydroxylase, DCX, PHOXB2
A noter que le biologiste qui réceptionne le prélèvement se réserve la possibilité de modifier ou compléter la prescription médicale initiale en fonction de l’indication clinique.
Méthode analytiqueAprès extraction des ARN totaux des cellules nucléées et une transcription inverse, l’ADNc est amplifié par PCR classique (simple ou nichée) ou par PCR quantitative.


Pour le sang et la moelle, il est possible, suivant la richesse du prélèvement et si le volume le permet, de grouper cet examen avec une analyse cytogénétique (caryotype et/ou FISH).

En cas de demande très urgente, contactez le biologiste responsable afin de réduire les délais de rendu.
Avertir le laboratoireNON
Information facturationB460 (code 1035) pour BCR-ABL, BHN600 (N509) pour transcrit de fusion du sarcome d'Ewing, BHN420 (N408) pour autre transcrit sans quantification, BHN500 (N451) pour autre transcrit avec quantification NC
CONDITIONS DE PRELEVEMENT
EchantillonSang ou moelle osseuse ou greffon ou prélèvements tumoraux
Choix du matériel de prélèvement
x1Tube stérile avec milieu fourni par le serviceou
x4Héparine de lithium 17UI/ml sans gel volume 5ml (Réf: 368 496)ou
Taille du tube10 ml || 5 ml
Désignation du matériel de prélèvementTube 5 ml VD4ml, bouchon Vert Héparine de lithium 17UI/ml sans gel
Tube conique stérile avec milieu
Référence fournisseur368 496 || Fourni par le service
Modalités de prélèvementsPRELEVEMENT :
- 4 tubes héparinate de sodium sans gel pour le sang (total de 15-20 ml)
héparine lithium accepté
- 1 tube stérile avec milieu de transport hépariné fourni par la cytogénétique pour moelle, greffon(mini 2 ml de prélèvement) ou biopsie.
Documents associés / Consentement
TRANSPORT
Transport au laboratoire et Conditions de conservationTempérature ambiante (15 à 25°C) pendant 24 heures
CONTACT LABORATOIRE
Contacts Laboratoire04 73 75 07 03
Conservation et transportDu lundi au vendredi de 8h30 à 17h00
SecteurCytogénétique onco-hématologique
FREQUENCE DES EXAMENS ET DELAI DE RENDU DES RESULTATS
Délai de rendu de résultat4 à 30 j
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