| Examen | NGS PANEL LYMPHOIDE |
| Synonymes | Recherche de mutations géniques impliquées dans les hémopathies lymphoïdes
Gènes ARID1A, ATM, B2M, BCL2, BIRC3, BRAF, BTK, CARD11, CCND1, CD79A, CD79B, CREBBP, CXCR4, EP300, EZH2, FBXW7, FOXO1, ID3, KLF2, KMT2D, MEF2B, MYC, MYD88, NFKBIE, NOTCH1, NOTCH2, PLCG2, POT1, PTPRD, SF3B1, STAT6, TCF3, TNFAIP3, TP53, TRAF2, XPO |
| Service exécutant | CYTOGÉNÉTIQUE |
| Site | CHU ESTAING
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| Laboratoire exécutant | |
| Principales indications | Hémopathies lymphoïdes |
| Méthode analytique | Après un ficoll pour enrichir en PBMC, l’ADN génomique est extrait et une librairie est obtenue par capture SureSelect sur le panel de gènes suivant : ARID1A* : exons 1 à 20, ATM* : exons 1 à 63, B2M : exons 1 à 2, BCL2* : exons 1 à 3, BIRC3 : exons 7 à 10, BRAF : exon 15, BTK : exons 14 à 16, CARD11 : exons 4 à 9, CCND1 : exon 1, CD79A : exons 4 à 5, CD79B : exons 5 à 6, CREBBP* : exons 1 à 31, CXCR4*: exons 1 à 2, EP300 : exons 1 à 31, EZH2 : exons 15 à 18, FBXW7 : exons 9 à 11, FOXO1 : exon 1, ID3* : exons 1 à 3, KLF2* : exons 1 à 3, KMT2D* : exons 1 à 54, MEF2B : exons 2 à 3, MYC* : exons 1 à 3, MYD88 : exons 3 à 5, NFKBIE* : exons 1 à 6, NOTCH1 : exon 34, NOTCH2 : exons 26 à 28 + 34, PLCG2 : exons 17 à 24, POT1*: exons 1 à 19, PTPRD* : exons 1 à 45, SF3B1 : exons 14 à 18, STAT6 : exons 12 à 18, TCF3* : exons 1 à 19, TNFAIP3* : exons 1 à 9, TP53* : exons 1 à 11, TRAF2* : exons 1 à 11, XPO : exons 12 à 18 [*transcrits séquencés en totalité]
Le séquençage est ensuite effectué sur séquenceur MiSeq Illumina. |
| Facturation | | Cotation | Tarification | | AHC/BHN 5570 - Code acte : N453 | 1503,9 € | | Total | 1503,9 € |
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